《疯狂原始人2》的剧情在原始世界的壮丽背景下展开。故事承接前作，主人公们经历了一连串的冒险后，终于找到了一个看似完美的家园。然而，新的挑战随之而来。一个更为先进、文明的家族出现了，他们拥有更高级的科技，生活方式也截然不同。

两个家族最初因为文化差异和误会而产生冲突，但在一系列意外事件中，他们不得不携手合作。面对自然的威力，无论是原始人还是文明人，都显得如此渺小。他们共同经历了火山爆发、猛兽袭击等种种危机，逐渐放下了成见，学会了彼此理解和尊重。

在这个过程中，主人公们不仅收获了友情和爱情，也对自己和世界的认知有了更深的理解。他们认识到，无论是原始的生活方式还是现代科技，都有其存在的价值和意义。最终，两个家族共同找到了一个适合双方共同居住的地方，开始了新的生活篇章。