《金陵神捕》的剧情发生在明朝的一个平静村庄——伏竹村。冬月初二，一场突如其来的大火打破了村庄的宁静，村中长老不幸身亡。为了查明真相，六扇门新晋女捕快杨梦言被派往调查。

抵达伏竹村后，杨梦言发现事情远比想象中复杂。村内接连发生怪事，又有两人神秘死亡，而她自己竟成为了新凶案的最大嫌疑人。在探寻真相的过程中，她意外牵扯出村中隐藏多年的惊天大秘密。

面对重重困境和疑云，杨梦言凭借着过人的智慧和勇气，逐步揭开了一个个谜团。最终，她不仅洗清了自己的嫌疑，还揭示了伏竹村大火背后的真相，为死者讨回了公道，也为村庄带来了久违的安宁。