《反恐特警组：潜龙突围》的剧情紧凑且充满张力。故事发生在西雅图的霹雳小组训练中心，该小组接到缉毒署的线报，称一家废弃货运中心疑似成为毒贩的据点。小组成员迅速行动，在一场激烈的枪战后，他们在一集装箱内发现了一名被绑的壮汉蝎子。蝎子的胳膊中植入了一枚关键芯片，内藏黑帮的重要犯罪证据，因此他成为霹雳小组的关键证人。

然而，黑帮得知消息后，不惜一切代价欲夺回蝎子及芯片，他们甚至冒充FBI，纠集私募军队对训练中心发动猛烈攻击。面对重重危机，霹雳小组与黑帮势力展开了一场惊心动魄的对决。在经历了一系列艰苦卓绝的战斗后，训练中心最终成功消灭了黑帮分子及其头目，蝎子也自愿将芯片交给了警方。但令人震惊的是，训练中心的女主任竟被揭露为黑帮的内线。影片以犯罪分子及内线被绳之以法作为结局，正义最终得以伸张。