《深渊幽灵》的剧情发生在深海之中，围绕着一艘神秘失踪的二战潜艇展开。故事从现代一支深海探险队发现这艘潜艇的残骸开始，他们带着好奇心与探索精神，决定深入海底一探究竟。随着探险的深入，队员们发现这艘潜艇内似乎隐藏着不为人知的秘密，似乎还有存活者的迹象。

在幽暗的海底，探险队遭遇了一系列诡异事件，似乎有某种超自然力量在阻挠他们的探索。随着对潜艇内部资料的逐步解读，他们逐渐了解到这艘潜艇在二战时期曾执行一项秘密任务，并因此卷入了一场惊心动魄的深海战斗。

电影最后，探险队揭开了潜艇失踪的真相，也发现了那些存活者的命运。整个故事在深海的幽暗与神秘中展开，充满了悬疑与惊悚，让观众仿佛身临其境，与探险队一同经历了这场深海之旅。