《碟中谍6：全面瓦解》的剧情紧凑且充满惊险。故事围绕伊森·亨特及其不可能任务小组展开，他们接到了一项艰巨任务——追回被恐怖分子窃取的三个大杀伤性核武器。在任务即将成功之际，为了拯救队友卢瑟的生命，核武器不幸被夺。中情局随后派遣特工奥古斯特·沃克协助伊森，但过程中，女特工伊尔莎的介入揭示了更深层的阴谋，政府内部潜藏着内鬼。

随着调查的深入，伊森发现这些核武器与辛迪加组织及其头目罗门-连恩有关，后者正密谋利用核武器制造灾难。伊森与团队穿梭于全球各地，从巴黎的繁华舞会到挪威的雪山，再到印度的医疗营地，与恐怖分子和潜伏的内鬼斗智斗勇。最终，在一场惊心动魄的决战中，伊森与队友们成功阻止了核弹的引爆，挽救了全球危机，而幕后黑手也得到了应有的惩罚。