《冰毒巨鳄来袭》的剧情发生在美国佛罗里达州的大沼泽国家公园。故事起始于一只普通的鳄鱼意外吞食了被毒贩遗落的面粉包裹，而这包裹中竟藏有冰毒。不久，这只鳄鱼发生了惊人的变异，眼睛变得血红，行为变得异常狂暴。

变异后的巨鳄开始在沼泽地肆虐，不仅捕食动物，还攻击人类。当地的居民和游客纷纷遭殃，陷入恐慌之中。为了对抗这头失去理智的怪物，市长请来了专门猎杀鳄鱼的专家，希望他们能尽快将巨鳄铲除。

然而，与巨鳄的斗争异常艰难。巨鳄的力量和速度都远超普通鳄鱼，而且它的皮肤变得异常坚韧，难以被普通武器伤害。在一场惊心动魄的激战中，人们终于找到了巨鳄的弱点，并将其成功制服。然而，这场灾难也让人们反思了人类对自然环境的破坏和滥用。