《灭绝：基因改造编年史》的剧情发生在不远的未来，一个名为Retrovirus的工业基因工具意外失控，导致了全球范围内的生物变异。短短两天内，九成人口因病毒而丧生，剩余的生物——包括人类、动物和植物——都发生了不可预测的变异。

在这个充满敌意、生态系统混乱的世界里，一小批对病毒免疫的人艰难求生。他们不仅要面对外界的变异生物，还要应对内部资源的匮乏和人际关系的紧张。在这场生存之战中，人们逐渐意识到，彼此之间的信任、合作和坚定的信仰是他们唯一的武器。

随着剧情的推进，幸存者们必须找到一种方法来对抗这个失控的世界，并寻找重建家园的希望。在这个过程中，他们不仅面临着重重困难，也发现了人类内心深处的力量和勇气。