《超级少女第二季》剧情紧张且充满未知。卡拉和她的盟友们继续他们的英雄使命，但新的挑战接踵而至。反外星人神秘组织“卡德摩斯计划”的出现，给所有外星难民带来了极大的威胁，特别是卡拉，她的身份和使命成为了焦点。荣恩·荣兹在获得赦免后，意外遇到了一位女火星人梅根·摩丝，却发现她与自己过去的灭族战争有着千丝万缕的联系。

詹姆斯也决定从摄影师的身份转变为正义的守护者，加入卡拉的团队。卡拉与达克萨姆星男子蒙·艾尔之间的情感纠葛也愈发复杂，尽管两人彼此吸引，但来自不同星球的他们始终难以跨越心中的障碍。随着犯罪活动的升级，卡拉和她的团队面临着前所未有的压力，他们必须团结一致，才能应对未来的挑战。