《远东特遣队之重点爆破》的剧情发生在1945年2月的远东战场，当时战事正处于战略反攻的前夕。特遣队接到一项艰巨任务：深入敌占区，铲除日军谋略队——一支由胡子头、土匪、兵痞和地主恶棍组成的日本铁杆汉奸特务队伍。

特遣队刚进入敌占区就遭遇谋略队的伏击，但凭借巧妙的战术，他们成功脱离险境，在一家客栈与联络员会合。然而，客栈老板竟是谋略队安插的特务，特遣队再次陷入危机。在一场激烈的枪战后，特遣队艰难突围，转移到森林深处的古炮台。

为摸清谋略队的行踪，特遣队队员乔装打扮，探听到谋略队藏匿于废弃砖窑厂。然而，狡猾的谋略队队长早有预谋，特遣队的突袭未能成功，反被对方伏击，队员杜刚被捕。最终，特遣队利用谋略队内部的矛盾，成功营救杜刚，并全歼日军谋略队，完成了任务。