电影《藏匿者》真实剧情发生在1949年新中国成立之后。银行工作人员乌陀、石头和天喜在执行一次重要的押送任务时，突然遭遇劫匪的埋伏。在这次混乱中，他们陷入了生死较量。由于劫匪的狡猾和行动的突发性，当地警察局开始怀疑所有知晓押送路线的人员，其中乌陀因在行动中保持清醒并能正常交流，成为了主要嫌疑人。

随着调查的深入，真相逐渐浮出水面。原来，这次事件并非简单的劫匪作案，而是保密局在祖国境内精心策划的一次行动，代号“萤火虫计划”。乌陀、石头和天喜在无意间成为了这一计划的牺牲品。电影通过这一事件，展现了新中国成立初期社会的不稳定和人性的复杂。